Допустим есть один жесткий диск с одним разделом С. Если подключить в комп еще один жесткий диск у которого тоже раздел есть С, как Виндовс себя поведет в таком случае?
На винчестере есть перемычки. Вы сами определяете, какой из хардов будет главным, а какой будет просто "висеть" в системнике, как дополнительный :) Тот, что главный - и будет грузить систему, а второй автоматом поменяет имена логических дисков. подробное описание (схематическое) есть на любом харде. там четко указанно, как сделать хард мастером, или слэйвом.
Остальные разделы обозначаются Виндами динамически, в зависимости от того, на каком физически диске они находяться -- D:, E:, F:, G:, и так далее. Соответсвенно, 1-й раздел второго физического диска (с системой) будет D:, второй раздел первого диска -- E:. Также зависит, как у тебя грузиться система -- через какой-нибудь загрузчик (bootmanager) или нет. Вариантов много.
Всё очень чётко видно, если зайти в "Панель управления" --> "Администрирование" --> "Управление компьютером" --> "Управление дисками". Тут осторожно -- можно такое наворотить... ))
Естественно, на дисках должны быть выставлены перемычки, определяющие, кто из них master, а кто slave. И определён порядок загрузки в BIOS. Но про это уже написали ))