Налогоплательщикам, применяющим специальный режим налогообложения, определённый статьёй 209 Налогового кодекса Украины (далее — Кодекс), в системе электронного администрирования налога открывается единый электронный счёт для учёта сумм налога как в рамках деятельности, определённой статьёй 209 Кодекса, так и в рамках другой деятельности.
В случае, если налогоплательщиком, который применяет спецрежим, по результатам отчётного периода задекларированы суммы налога, которые подлежат уплате как в бюджет, так и на его специальный счёт, средства с его электронного счёта, в первую очередь, перечисляются в бюджет, а в случае полного расчёта с бюджетом — на специальный счёт такого плательщика (пункт 22 Порядка №569).Такое перечисление осуществляется на основании реестра, который автоматически формируется ГФС Украины на основании представленных плательщиками налоговых деклараций по НДС и направляется Казначейству. Перечисление суммы налога в бюджет и/или на специальные счета плательщиков налога с их электронных счетов осуществляется Казначейством в пределах остатка таких средств на электронных счетах (пункт 21 Порядка №569).
Указанное правило касается также и плательщиков налога — сельскохозяйственных предприятий всех форм собственности, которые отвечают критериям, определённым статьёй 209 раздела V Кодекса, но не зарегистрировались как субъекты специального режима налогообложения.